Internet, MEDLINE®, et le pédiatre

 Dr med. V. Griesser
médecin-informaticien
Division d'informatique médicale
Responsable du Laboratoire nomenclatures et classifications

Hôpital Cantonal - Hôpitaux Universitaires de Genève - HUG
1211 Genève 14

 e-mail : vincent.griesser@hcuge.ch

Résumé

L'arrivée des nouvelles technologies de l'information (NTI) et d'Internet en particulier sont en train de modifier radicalement l'accès à l'information et par là aux connaissances. Le domaine de la médecine n'échappe pas à cette formidable révolution : médecins et patients peuvent maintenant consulter librement et presque gratuitement une bibliothèque de plusieurs millions de pages. L'Internet et la base de données bibliographiques MEDLINE sont présentés dans cet article.

Introduction

Le pédiatre, de par la complexité (étendue et diversité) de sa spécialité et de par la population des patients (parent, enfant, adolescent) dont il s'occupe, se verra un jour ou l'autre interroger au sujet de l'Internet ! Ignorer ce nouveau média est donc quasi impossible.

De plus, il est aujourd'hui devenu difficile de maintenir à jour ses connaissances, tant celles-ci évoluent rapidement. Or, il est coûteux de s'abonner aux nombreuses sources d'informations. C'est là qu'Internet entre en jeu et se révèle une source incontournable et inestimable de formation permanente. Cette source d'information et de formation est accessible à tout un chacun et pour un prix des plus modeste.

Les parents des enfants ainsi que les adolescents constituent l'essentiel des patients vus par le pédiatre. Cette population jeune est justement friande d'Internet. Aussi, il est naturel d'entendre, de plus en plus fréquemment, des confrères signaler l'arrivée d'un tiers lors de la consultation. Ce tiers s'appelle Internet.

Cet article constitue une introduction à l'Internet et au système MEDLINE en particulier.

1. Comprendre l'Internet et le World Wide Web ⁽¹⁾ 

Qu'est-ce que l'Internet ?

L'Internet est un réseau mondial d'ordinateurs abritant une quantité considérable de données accessibles directement à partir d'un ordinateur personnel. Les connexions à l'Internet se font grâce aux liaisons à hautes vitesses (autoroutes de l'information) assurées par des sociétés commerciales appelées prestataires ou fournisseurs d'accès. Si le volume et la diversité des informations disponibles peuvent sembler écrasants, les techniques de base sont relativement simples : nul besoin d'être un spécialiste en informatique pour profiter de l'Internet.

Dès lors que vous aurez équipé votre ordinateur d'un modem et souscrit un abonnement auprès d'un fournisseur d'accès, vous pourrez commencer à explorer (butiner, surfer) le Net à l'aide du logiciel de navigation (browser) de votre choix.

Qu'est-ce que le World Wide Web (WWW) ?

Considéré par de nombreux utilisateurs comme l'aspect le plus passionnant de l'Internet, le Web (la toile) en est certainement le domaine connaissant l'expansion la plus fulgurante : il offre déjà 260 millions de pages à visiter, sans compter les milliers d'autres qui apparaissent chaque mois.

Le Web est un univers en soi, constitué de pages d'accueil (home pages) où fourmillent textes, images, sons, et vidéo.

Chaque page communique avec les autres pages par des liens dynamiques. Le Web peut également être utilisé pour télécharger des fichiers et des documents hébergés sur d'autres types de sites Internet.

Le Web est fondé sur un langage informatique dit HTML (hypertext markup language), créé dans les années 80 par Tim Berners-Lee, qui conçut l'idée d'un réseau d'informations électroniques.

Les pages Web offrent une extraordinaire diversité de sujets, présentés sous une forme facilement accessible, mais aussi séduisante et intéressante. L'information disponible étant interactive, surfer sur le Net est comparable à l'utilisation d'une immense collection de CD-ROM multimédia : en cliquant sur une zone "dynamique", on accède à un nouvel écran relié au précédent.

Rechercher l'information sur le Web

Trouver précisément ce que l'on cherche parmi les millions de pages existant sur le Web est à première vue un immense défi. Il existe cependant de puissants outils de recherche indexant les sites Web ainsi que les forums de discussion et qui affichent, en quelques secondes le résultat de la recherche selon vos critères.

Les deux principaux outils de recherche sont les moteurs de recherche (search engines) et les répertoires Web. Ces deux types d'outils peuvent avoir une portée générale, c'est-à-dire couvrir l'ensemble du Web ou une portée spécifique par exemple le domaine de la santé.

On observe une tendance sur le Web où certains sites - appelés portails - offrent des pages "tout-en-un" (all-in-one). Ces sites offrent des pages avec des liens directs sur les principaux moteurs de recherche ainsi que des sélections thématiques de sites Web (répertoires).

A titre d'exemple, j'ai choisi, ci-après, l'adresse de sites Internet illustrant ces trois types de site Web. Ces trois références valent un détour ! N'hésitez pas à y chercher de l'information (p.ex. diabète, asthme, autisme, ADHD, etc.); vous serez surpris de la richesse du contenu du Web !

Exemples des trois types de sites Web :

2. Le système d'information MEDLINE

Le 26 juin 1997, le vice-président américain Gore annonçait, lors d'une conférence de presse, la mise à disposition gratuite de MEDLINE sur Internet.

Depuis cette date, l'utilisation de MEDLINE montre une croissance régulière non seulement de la part des professionnels de la santé mais aussi des citoyens-patients du monde entier.

Le 10 juillet 1999, la Bibliothèque nationale de médecine (National Library of Medicine - NLM) des Etats-Unis d'Amérique a procédé à l'enregistrement de la 10 millionième référence dans le système MEDLINE.

La base de données MEDLINE

Caractéristiques de la base de données bibliographiques MEDLINE :

§         Le producteur de MEDLINE est la National Library of Medicine (NLM), Bethesda, USA

§         4'300 journaux de plus de 70 pays sont régulièrement indexés

§         410'000 documents sont ajoutés chaque année

§         plusieurs centaines de périodiques offrent un accès direct au texte complet

§         création en 1966, plus de 10'000'000 références sont actuellement disponibles

§         indexation des références par un vocabulaire contrôlé (thesaurus) riche de 44'000 descripteurs (Medical Subject Headings MESH)

§         5'000'000 recherches sont actuellement effectuées chaque semaine

La base de données MEDLINE est constituée de références bibliographiques organisées en paragraphes structurés. Voici un exemple d'une référence Medline:

Chaque paragraphe commence par deux lettres majuscules. Ces lettres indiquent le contenu respectif des paragraphes. Citons les paragraphes suivants:

TI :          titre anglais

TT :        titre dans la langue originale (ici en français)

SO :        la source de la référence

AU :       les auteurs de la publication

AD :       l'adresse du premier auteur

MJ :        les mots clé MESH majeurs, par ordre alphabétique

MN :       les mots clé MESH mineurs, par ordre alphabétique

AB :        résumé (abstract) caractérisant l'article original

EM :       date de la mise à disposition dans Medline, ici mars 1997

LA :        langue de la publication originale, ici le français

MEDLINEplus®

Dès la mise à disposition gratuite de MEDLINE, un succès considérable a vu le jour. Professionnels de santé, chercheurs, éducateurs, patients et citoyens du monde entier se sont littéralement rués sur cette source d'informations précieuses. Afin de faciliter l'interrogation du trésor MEDLINE, un nouveau service a été mis à disposition en novembre 1998. Il s'agit de MEDLINEplus. A ce jour, plus de 500 recherches, dans les domaines les plus variés de la santé, sont régulièrement tenus à jour. Les interrogations de la base MEDLINE sont programmées par des chercheurs professionnels. A cela s'ajoute, un nombre important de liens de qualité vers les sites professionnels (sociétés savantes, agences gouvernementales, etc.) ainsi que les sites éducatifs et d'association des patients.

Une visite à MEDLINEplus (http://www.nlm.nih.gov/medlineplus) s'impose, vous ne le regretterez pas.

Voici une sélection, parmi les 500 recherches pré-programmées, des 50 premiers thèmes de recherche de MEDLINEplus pertinents pour la pédiatrie :

La National Library of Medicine (NLM) offre actuellement 3 moteurs de recherche. Ce sont respectivement Internet Grateful Med, PubMed et MEDLINEplus. Je vous recommande de choisir votre moteur de recherche à partir de la page qui décrit ces trois systèmes : http://www.nlm.nih.gov/databases/freemedl.html

Sélection des pages principales de la bibliothèque nationale de médecine (NLM):

3. Chercher et trouver l'information pertinente

Lorsque l'utilisateur désire procéder à une interrogation bibliographique, il doit avoir présent à l'esprit la façon dont la base de données est organisée. Du plus, il est fort utile qu'il connaisse la terminologie utilisée dans les thesaurus respectifs (MESH). Cela lui assurera une plus grande pertinence dans les réponses fournies.

Figure 1 - de la réalité aux termes en passant par le concept

Tout l'art de la recherche documentaire consiste à traduire les concepts recherchés en termes et descripteurs compréhensibles par l'ordinateur. La figure 1 illustre ce problème : comment traduire la notion d'arbre en termes compréhensibles par l'ordinateur ? N'oubliez pas les diverses langues et les diverses notations au sein d'une langue (genre et nombre).

Malgré tous les développements informatiques récents, les logiciels ne sont pas encore capables de travailler au niveau des concepts.

Lors de recherche avec des abréviations, des surprises sont à craindre : si vous recherchez par exemple l'abréviation "DRG", vous recevrez aussi bien des articles sur le "dorsal root ganglion" que des articles parlant des "diagnosis-related groups" !

Moteur de recherche : logique floue et opérateurs booléens

Chaque logiciel d'interrogation dispose d'un certain nombre d'avantage. La puissance d'un logiciel réside dans son moteur de recherche : permet-il la recherche en logique floue ou n'autorise-t-il que la recherche avec les opérateurs booléens ? La recherche en logique floue couplée avec la gestion des variantes lexicales (gère le genre et le nombre des formes lexicales) figure parmi les outils les plus modernes. Cette forme de recherche autorise les questions en langage quasi naturel.

La plupart des langages de recherche permettent aussi l'emploi des opérateurs booléens AND, OR et NOT, ainsi que les parenthèses grouppantes pour isoler des groupes de termes.

Figure 2 - exemples d'opérateurs booléens

La figure 2 montre l'usage de trois opérateurs booléens :

Texte entré : arbre OR tree

      trouve tous les documents qui contiennent arbre OU tree

      Texte entré : myocardial AND infarction

      trouve tous les documents qui contiennent myocardial ET infarction

      Texte entré : image NOT angiography

      trouve tous les documents qui contiennent image ET PAS angiography

Dans ce dernier exemple, il convient d'observer l'importance de la séquence des mots entre l'opérateur NOT. La préséance des mots affecte le résultat de la recherche.

4. Auto-apprentissage

Pour un auto-apprentissage, je vous recommande de passer quelque temps sur le site de la National Library of Medicine (NLM) à Washington. En utilisant l'accès à la page de départ (home page : http://www.nlm.nih.gov/), vous vous assurez d'être tenu au courant des nouveautés. Ce site est particulièrement dynamique et il vaut la peine d'être visité régulièrement. De plus, il donne accès aux trois moteurs de recherche MEDLINE.

Le site en langue anglaise "New Hampshire NLM Projet" représente un excellent site d'auto-apprentissage en relation avec la recherche d'informations sur Internet. Sa page "Medline Tutorial" (http://www.nhmednet.org/nlm/tutorial.htm) présente un didacticiel fort bien conçu.

Le portail "l'Internet et la Médecine" (http://www.cmic.ch/formation/savoir.htm) est un site hautement instructif. Ce site, en langue française, donne de nombreux liens pertinents. Les mises à jours régulières sont une source de découvertes renouvelées.

Enfin, je vous recommande le site français "Voila®" qui offre un remarquable outil de traduction (http://www.voila.fr/Trans) entre les langues anglaise, française et allemande. Il est souvent fort utile de disposer d'une traduction dans sa langue maternelle, même si le traducteur commet encore des contresens.

C'est en surfant sur le Web que vous développerez votre propre style. Je vous souhaite donc de fructueuses découvertes.

Conclusion

Grâce aux progrès de l'informatique et à la mise à disposition de puissants moyens de communication, il est désormais possible de procéder soi-même à l'interrogation des bases de données bibliographiques sur Internet. Cela est rendu possible grâce à des logiciels d'interrogation (moteurs de recherche) "intelligents" et conviviaux.

La recherche bibliographique assistée par ordinateur constitue une aide efficace à l'actualisation des connaissances médicales et participe donc à la formation continue des professionnels de la santé. En effet, il est possible d'accéder facilement à l'information sélective nécessaire à une prise en charge efficace du patient moyennant une formation de base minimale. Une initiation simple à l'Internet est souhaitable et évitera bien des déboires.

Au terme de cette présentation, j'espère vous avoir convaincu que la recherche bibliographique est désormais à votre portée.

La relation patient-médecin est en partie modifiée par l'apparition de ces nouvelles technologies de l'information (NTI) et en particulier de MEDLINE gratuit sur Internet.

Cependant, il est bon de se rappeler que la recherche documentaire reste un art et qu'il n'y a pas de réponse sûre à 100 %. En effet, deux difficultés subsistent quelles que soient la puissance et la sophistication du moteur de recherche. Ces deux difficultés s'appellent le bruit et le silence lors de la recherche.

Le bruit se caractérise par le fait que certains documents non pertinents se glissent parmi les réponses fournies, alors que le silence - plus grave - est défini par le fait que certains documents pertinents peuvent ne pas être pris en compte lors de la recherche.

Aussi, en guise de conclusion ne saurait-on trop recommander de suivre une formation minimale auprès d'un surfeur qualifié !

Enfin, je vous souhaite beaucoup de plaisir lors de vos recherches personnelles, il vous arrivera souvent d'expérimenter le phénomène de sérendipité qui consiste à découvrir ce que vous ne cherchez pas.

Références et sites Web mentionnés

§         Moteur de recherche générique couvrant l'ensemble du Web : http://www.altavista.com/

§         Moteur de recherche spécialisé au domaine de la médecine et de la santé : http://www.hon.ch/

§         National Library of Medicine (NLM),Washington : http://www.nlm.nih.gov/

§         MEDLINE gratuit : http://www.nlm.nih.gov/databases/freemedl.html

§         Site d'auto-apprentissage : http://www.nhmednet.org/nlm/tutorial.htm

§         Portail "l'Internet et la Médecine" : http://www.cmic.ch/formation/savoir.htm

§         Voila®, traducteur de site Web : http://www.voila.fr/Trans

101 trucs et conseils. Découvrir l'Internet. Edition Fontaine 1997, Paris. 71 pages (ISBN 2 84270 025 2). Excellent ouvrage d'initiation à l'Internet